在马英九总统任期只剩下一个多月的时候，提案希望马总统能够在这个时候，特赦前总统陈水扁。提案一出，立刻又引发台湾朝野争论不休。高雄市议会议长康裕成认为，他们提这个案子，是希望在马总统卸任前，能够充分展现元首高度，民进党籍高雄市长陈菊也认为，如果马总统能够特赦陈水扁，将有助促成蓝绿和解，她个人非常赞同。此外，前行政院长谢长廷则是认为，特赦陈水扁不是法律问题，而是政治问题，政治问题就应该政治解决。如果由马总统来做，能显出马总统的肚量，也给马总统制造蓝绿和解的机会；但如果由蔡英文来做，就有人会有争议。