在星期二上午发生恐怖主义袭击事件以后，美国政府立即调动近 8 千名联邦调查局及其它情报部门人员展开美国历史上规模最大的调查和搜索行动。 据洛杉矶时报等媒体报导，美国司法部长阿什克罗夫特透露说，仅美国联邦调查局就调动了4千名调查人员以及3千名辅助性人员，占联邦调查局人员总数的四分之一。调查活动从东北部的缅因州到最南部的佛罗里达州并横跨美国大陆到加利福尼亚州全面展开。美国官员表示，通过调查航空公司登机记录、护照档案、租车记录等，他们相信掌握了大多数自杀性劫机者的身份。劫机者至少有 12 名，可能多达 24 名。司法部长阿什克罗夫特表示，一共有4组劫机犯，每组 4 到 6 人参与了劫持美利坚和联合航空公司的4架客机的活动。除一架在宾夕法尼亚坠毁以外，两架撞向纽约世贸大楼，一架撞上五角大楼。
*恐怖分子受过飞行训练*
司法部发言人塔克尔女士星期三晚间说，每一架被劫持客机上至少都有一名在美国接受过飞行训练的恐怖分子，其中几人拥有驾驶员执照。星期三，根据信用卡收据得到的线索，装备精良的联邦调查局特工搜查了波士顿市中心的一家饭店，拘留了 3 人，在经过问话之后，这 3 人被释放。另外，有关当局还在波士顿扣押了一个与本案有关的证人。此人的信用卡被用来为7名嫌疑劫机犯购买了 7 张机票。不过，司法部表示，星期二被拘留的人还没有被正式逮捕也没有受到任何指控。另外，联邦调查局还根据在波士顿机场一辆租车里发现的线索，搜查了佛罗里达南部的 3 家飞行驾驶学校。当局表示，两名涉嫌劫机犯持工作签证进入美国，从去年夏天开始在一个叫霍夫曼航空国际公司学习驾驶客机。这两个嫌疑犯持有阿拉伯联合酋长国的护照。另外，联邦调查局根据从另一辆租车里找到线索，搜查了佛罗里达州韦罗海滨市一所住房。调查人员在房间内发现一对兄弟的飞行驾驶执照。据房东介绍，这对兄弟和另一位住在相邻房子里的男子自称是沙特阿拉伯驾驶员，同妻子和孩子住在这两所房子里。这对兄弟今年 8 月底搬出，另一个男子上个周末也搬走了。有关方面相信，这对兄弟驾驶飞机撞上世贸大楼。据报导，调查人员还在佛州搜查了另外 4 所住房和一处公寓，寻找其他嫌疑犯的线索。
