在两岸关系方面，北京警告台湾不要继续挑战九二共识。学者认为，保持僵局对台湾不利。中共中央台湾工作办公室、国务院台湾事务办公室主任陈云林警告说，如果台湾当局继续挑战一个中国原则、进一步否定两会共识，甚至策划新的分裂活动，只能毒化两岸关系，制造紧张和对抗，最终损害的是台湾同胞的利益。
陈云林在海协会成立十周年大会上说：“北京有充份准备及决心，粉碎任何台独分裂图谋，而两岸能否恢复对话及打破僵局，依然取决于台湾当局对九二共识的态度。”海协会会长汪道涵也表示，如果台湾拒绝承认九二共识，就是没有改善两岸关系的诚意。
*两岸恢复谈判可能性不大*
台湾今年县市长和立委选举之前，台湾总统陈水扁明确提出，承认92共识就是出卖中华民国。香港时事评论员李怡说，陈水扁否认92共识以后，两岸恢复谈判的可能性不大：“ 不谈对大陆没有什么影响，大陆在不民主的制度下，既没有选民的压力也没有舆论的压力，又没有经济的压力；反而是台湾会有类似的压力。”他认为僵持下去对台湾不利。
北京联合大学台湾问题研究所的朱显龙教授认为，如果僵局激化，出现战争对海峡两岸都不利，而首先受害的是台湾：“战争对双方都是有害的，但是如果台湾宣布独立，大陆一定会付诸武力。如果战争出现对双方不利，尤其是台湾，因为首先战场在台湾。”
朱显龙分析北京所说“粉碎台独分裂图谋的充份准备和决心”时说，中国就是要以武力解决问题：“大陆一方面准备经济建设，搞好经济，台独势力也没有市场；另一方面是加强军备和训练。一旦台湾宣布独立，大陆一定会及时采取相应办法，包括军事行动。”
朱显龙教授认为台独势力不顾大陆威胁锲而不舍有其原因：“台独势力认为大陆没有能力维护自己的统一 ；再有就是，一旦发生战事， 美国会进行援助。他们的认识有一些合理性，台湾有一定的军事力量，美国也在世界各个地区干预，因此这种认识也有一定现实性。”
*大陆重点应付入世后的经济*
不过香港时事评论员李怡说：“从中国对台湾月初的选举来看，中国并没有象几年前那样虎视耽耽，它的重点仍是经济建设：“大陆对台湾这次选举并不十分重视，除了高层几个人，其余大部份官员都在关心经济问题。目前大陆的经济状况和国际社会的状况下，台湾走不掉。大陆在‘不放弃动武、统一、政治谈判’等方面都提得不多。因此看来，整个工作都在应付WTO以后的经济，以经济吸引台湾、台商， 经济是有效的磁力。”
海协会会长汪道涵说，两岸先后加入世贸组织，为两地经济交流及直接三通，创造更有利的条件。他在书面讲话中指出，不管台湾政局如何变化，在“九二共识”的基础上重开对话与谈判，是打破政治僵局、改善两岸关系的关键。
