据分析，有迹象显示，台湾副总统吕秀莲可能在执政的民进党调整决策机制的酝酿过程 中，进入台湾最高领导层的核心决策小组。 据台湾报纸报导，台湾总统府三个星期前召开高层秘密会议期间，吕秀莲被陈水扁指定参加会议，民进党党内高层人士已经明了陈水扁让吕秀莲参加决策的想法。
中国时报报导，在这次高层会议前，台湾总统府已经在蕴酿扩大陈水扁总统的决策机制，核心决策小组成员将达到5人到7人。报导指出，在上周末举行的执政党会议期间吕秀莲曾代表陈水扁聆听发言者提出的意见。报导说，这显示陈水扁已经把吕秀莲纳入构思中的五至七人核心决策小组。 近来，两岸互动似乎出现了多年来少见的缓和气氛，然而被北京视为激进台独分子的吕秀莲在这个时候可能进入台湾领导层的决策核心意味着什么呢？
*稳固两岸关系不变*
台湾淡江大学大陆研究所的张五岳认为，陈水扁总统考虑让副总统吕秀莲进入决策圈，主要是为了平衡民进党内部力量和台湾岛内政治的考量，对两岸关系不会产生重大影响。他说，“吕秀莲纳入决策机制，主要是基于民进党的政治生态和台湾内部的政治考量 。我想跟两岸关系基本上没有很大关系。现阶段就陈水扁竞选连任的需求来看，两岸关系基本上是以稳定为基本格局要件，但两岸关系并不是现阶段台湾政府主要争取的票源，或者主要的争取进一步突破的诉求重点。”
张五岳指出，陈水扁政府目前面临的主要任务是拼经济和扫除黑金政治和官场腐败，两岸关系只要稳定就可以，因此陈水扁不急于推动两岸关系上的大幅度开创和进展。他表示，陈水扁既需要稳定两岸关系，又必须为竞选连任而巩固现有的民进党基本教义派票源，所以不能排除陈水扁将在两岸关系和台湾内部政治议题上跟吕秀莲副总统来扮演不同角色的可能性。张五岳说，“我想说，充其量也是所谓的黑脸和白脸的角色。 但是基本上这个黑脸的角色是不能破坏两岸关系基本上互信和稳定的格局的。 所以我相信，她这种功能角色的扮演目前来看还是非常有限的。”
*两岸直航和三通重大考验*
台湾政治大学政治学教授张麟征认为，陈水扁在两岸关系方面的决策受到美国对台政策的影响，吕秀莲的激进主张在当前国际形势下应该不会主导台湾的两岸政策和外交事务。张麟征说，“陈水扁在某方面来说，在两岸关系上最近可能承受到来自美国不可言喻的若乾压力。 如果美国不希望在美国的多事之秋 ，在伊拉克和北韩问题都炒得这么火热的时候，再见到台海两岸再生波澜的话，我想，美国对于陈水扁的约束力会比较大。那么，即便吕秀莲有一些躁进的想法 ，她其实对陈水扁能够发挥的影响也是有限的。”
张麟征强调，如何处理两岸直航和三通问题，是对陈水扁总统是否愿意改善两岸关系的真正考验。她说，“我觉得他(陈水扁)最可能的一个作法就是在言辞上会对改善两岸关系表达非常多的善意，在作为上，他大概不会有所作为，至少目前看来是这样。如果真的有所转变的话，就要看他对于三通直航是不是真的来做。如果三通直航始终是口惠而实不至，我觉得，陈水扁的两岸政策就是说一套做一套喽。”
台湾总统陈水扁在不久前发表的元旦讲话中重申了他两年以前上任之初提出的“四不一没有”的承诺，并且表示将努力为两岸关系寻求长期和平稳定的互动架构，作为两岸在21世纪的前20年发展经济的有利条件。他稍后又表示，当前应该是两岸恢复谈判协商的新契机。
