台湾领导人陈水扁表示，台湾政府必须选择坚定支持美国反恐的立场。与此同时，台湾出现支持和反对政府政策的反响被认为是民主社会自由表达意见的正常现像。
美伊战争打响之后，台湾30多个民间团体发动了数百人到美英两国在台北的办事机构和台湾外交部举行抗议活动。抗议者中也有一些美国人和其他西方国家的人士。一些抗议者对台湾政府表态支持美国解除伊拉克武装的政策提出批评。台湾立法院也有一些立法委员对台湾政府的政策提出质疑。来自金门的新党立法委员吴成典星期五在立法院发言时说，“到底我们台湾支持战争对，还是反对战争对？如果你是真心爱台湾，就必须反对战争。”
台湾总统陈水扁在接见来访者的时候强调，战争是不得已的最后手段，台湾政府会支持美国反恐。这位台湾领导人列举1996年台海危机和2000年总统选举等历史事件指出，台湾必须有所选择，美国在过去多次重大事件中力挺并协助才让台湾得以渡过难关，所以台湾必需坚定意志，表达支持美国的立场。 陈 水扁表示，为了世界真正而且永久的和平，绝不容许这种大规模杀伤性武器继续存在或者无限扩散。
*自由社会容纳反战的声音*
另一方面，美国对伊拉克采取的军事行动和台湾政府的挺美立场在台湾立法院获得了一些立法委员的赞同。民进党立委林浊水说，“如果能够透过这次战争，反恐有进一步的结论，那当然是件好事情。” 这位作家出身的立法委员指出，在台湾这样的民主社会，支持和反对战争的声音同时存在属于正常现像，应该以平常心看待。林浊水说，“世界各地，固然有相当多支持，但是像美国这样支持度比较高的国家，它反战的声浪其实比台湾的反战还要高得多。所以这样的反战，我觉得，还是一个正常社会自由表达的范围。” 他还指出，反战者在台湾社会所占的比例比美国还小得多。
台湾行政院长游锡昆也在立法院表示，全世界有数十个国家向美方表达支持立场。他说，台湾支持反恐的立场，也是基于联合国687、1441号决议授权的立场，支持反恐行动。
与此同时，警方对台北市内一些重点设施加强了戒备。在美国、英国的驻台湾机构、一所美国学校周围以及台湾政府的一些机关大楼外面，都可以看到荷枪实弹的警察在执行巡逻任务，比往常似乎多了一种紧张气氛。不过，民众的生活看来并没有受到明显的影响。
