绝大多数专家认为，萨斯病毒产生于大自然。但是也有人认为萨斯病毒是人工制造的，是实验室的产物。
*因特网美国阴谋论*
密切注视萨斯问题的生物化学博士方舟子在接收美国之音采访时说：“中国的网络上有不少这样的说法，认为萨斯是美国制造的生物武器，是美国在中国投的毒。但是这种说法是没有什么根据的，萨斯病毒的基因组序列已经测出来了，从这个序列可以判断出它不象是人工制造的，而是一种新型的冠状病毒。冠状病毒在自然界中已经存在了，我们人体也有，普通的感冒大概有百分之二三十是冠状病毒引起的。”
科学作家方舟子在批驳那种“美国阴谋论”的时候，谈到一篇在网上流传的中文文章。那篇文章据称是“《真理报》消息”，不过方舟子从那篇文章的措辞来判断，认为是出自某个中国人的手笔。其中引用所谓的“俄罗斯医学科学院院士卡雷辛柯夫”的话说，“非典型肺炎是麻疹病毒与流行腮腺炎两种病毒的混合种，而这种混合病毒只有在实验室里才可以做出来。”方舟子指出，且不说是否真有这么个俄国院士，这个论断本身就很容易推翻。如果萨斯病毒是那两种病毒的“混合种”，那么那两种病毒和萨斯病毒的基因组序列必定存在高度的相似性或者说“同源性”。把这三种病毒的基因组序列做个比较，就可以发现它们不具有同源性。
*非典不是生物武器*
有个谣言说，在萨斯病毒基因组中发现了一段比较长的，没有编码功能的核糖核酸序列，经过破译，发现它的含义是“美国制造”。有些中文的网络文章正面或者侧面的引用了这个说法，而没有明确指出这是谣言。美国的中文学术文化网站[新语丝]的负责人方舟子说：“那段序列根本就不存在，我去检索过，萨斯病毒基因组不包含那段序列。实际上，在已经测出来的所有生物基因组系列当中也都不包含那段序列，那完全是人为编造出来的一段序列。”
记者和方舟子都没有在中文的传统媒体上看到这类“美国阴谋论”和谣言，而只在因特网上看到过。《华盛顿观察》周刊不久前报道说，最近在中文电子邮件和聊天室颇为流行的一些文章，影射“非典”是美国生物武器在中国“练兵。”美国红十字会的高级技术顾问格拉保尔斯基大夫说：“这种流言让我想起来艾滋病刚刚开始在非洲流行时广为流传的类似谣言。那就是艾滋病是美国在非洲故意散播的病毒。当然我们后来都知道这种说法是无稽之谈。我相信科学家会调查和研究非典病毒，到时候会有证据表明非典是不是生物武器。”后来《中国青年报》等不少中国报纸和网站都相继引用了这段话。
*萨斯病和野生动物*
不少学者认为萨斯病毒来自动物，特别是野生动物。不久前中国科学家的一些发现强化了这种观点。不过这些发现也引起了争议。香港大学和深圳疾病预防控制中心锁定果子狸为萨斯病毒来源。他们宣布，从果子狸标本中分离出的萨斯样病毒， 经过基因分析，证实它是人类萨斯病毒的前体。这个消息受到世界媒体的广泛报道。不过也引起不少质疑。例如有专家认为，查出萨斯病人身上的病毒与6只果子狸身上的萨斯病毒之间有99%的同源性，并不能说明是果子狸把萨斯传染给人，其实，百分之一的基因差异是很大的，特别是对病毒来说。
*动物感染可能性*
世界卫生组织评论说，有关野生动物在传播萨斯病毒方面的潜在作用的信息，对于全面认识萨斯病非常重要，在做出肯定的结论前，应当进行更多的研究。还没有证据证明这些动物在萨斯病爆发中起到重要作用，不过也不能排除这些动物就是感染人类的病源的可能性。为了安全，那些可能与这些物种或者这些物种的产物，包括体液和分泌物有接触的 人，应该提高警觉，特别是在密切接触期间，例如搬运、屠宰、食品加工和食用这些食品的时候。
*萨斯成为全球挑战*
世界卫生组织还认为，这项研究初步表明萨斯病病毒也存在于人体以外的宿主，不过还有许多基本的问题有待解答。而且这项研究中检验的动物样本只来自一个市场，现在还没有确定萨斯病毒是否广泛的存在于这些动物身上。中国广东的研究人员发现，接触野生动物的人接触萨斯病毒的机会比较多，不过其中一些人已经产生了抗体，所以没有发病。广东非典科技攻关小组对野生动物批发市场的508名工作人员进行检测，发现在13%的人的血液中，萨斯病毒抗体呈阳性。而在一般人之中，这个比例是6.3%。 在这些野生动物批发市场工作人员中，经常接触果子狸、山猪、兔子和蛇的人，萨斯病毒抗体呈阳性的比例更高。而深圳市疾病控制中心发现，在10份野生动物经营者的血清样本里，抗体呈阳性的，就有5个。
世界卫生组织的萨斯研究专家斯托尔表示，虽然这些判断还不是结论，还需要做进一步探索，但是这些研究进一步加强了野生动物是萨斯病传染源的论点。斯托尔还说，这也说明，萨斯散布的范围比我们看到的更广，我们难于完全消灭它。世界观察研究所的高级研究员润纳说，萨斯已经成为全球性挑战。他说：“就象许多其他挑战一样，萨斯不是一个国家可以单独面对的，这突出显示我们迫切需要环球合作。”
