台湾中央选举委员会26号下午，决定公告总统及副总统当选人名单，大批民众包围中选会，阻挠张贴当选人名单，并引发警民流血冲突，场面非常混乱。台湾大陆委员会指出，大选后的群聚抗争，令政府难以凝聚民众集体意志，支持两岸谈判。
台湾中央选举委员会在26号下午开会后以14票对2票，通过公告陈水扁、吕秀莲为总统副总统当选人，并准备张贴当选人名单。大批国亲支持者，在立法委员带领之下，包围中选会大门，他们认为选举结果的争议仍未解决，不应该公布当选人名单。
*国亲支持者与警方发生冲突*
为了阻挠台湾中央选举委员会(中选会)张贴当选人名单，有人破坏公布栏，并且向中选会大门掷鸡蛋、石头、甚至以棍棒拷打玻璃大门，碎片伤及民众。在场维持秩序的警员，与情绪激动的民众发生流血冲突，场面非常混乱。这次是台湾选举史上，首次发生抗议公告当选人名单的流血冲突。
大陆委员会25号召开委员会会议，讨论总统大选之后的两岸关系，企划处处长詹志宏在记者会上表示，民进党政府现阶段应该先处理总统大选后的群聚抗争，令台湾内部的民众情绪先冷静下来，才可以推行大陆政策。
詹志宏说，台湾需要内部共识和团结，如果情况不能够获得缓和的话，政府如何以一个团结的集体意识，来支持政府从事两岸谈判。詹志宏并表示，在北京的「一中原则」之下，两岸难以展开政治层面的协商，因此，委员会认为，两岸短期内应该先就经贸，以及直航等问题展开谈判。
*台学者：北京需要调整对台政策*
台湾国防大学国家战略研究中心研究员陈伟华表示，总统大选之后，台湾的民众分成两半，一半认同台湾的主权，另一半民众认为，现在还不是时候谈主权问题，北京领导人面对这样分裂的民意，对台政策应该会因应调整。陈伟华认为，北京一方面会同时跟民进党、国民党交往，同时也会用另外一种手段跟民进党做国际舞台上的抗争。
中国文化大学大陆研究所教授陈毓钧表示，北京在过去四年，已经不再信任陈水扁，这次的总统大选结果又引起争议，如果验票结果仍然是陈水扁连任，相信短期内两岸关系仍然难以突破。陈毓钧认为，今年内要突破两岸关系并不容易，因为年底台湾还有立法委员选举，还有美国11月的总统大选，要有所突破很困难。
另外，在台北市总统府前的群聚抗争已经进入第6日，泛蓝阵营并且发动「327拼公道、救民主集会」，地点在总统府周边，估计有数十万民众参与。
