在扁马会落下帏幕之后，台湾的政治评论人士对这次会面的意义以及将来是否还会有后续的扁马会发表了不同的看法。
台湾媒体资深政治评论人士杨宪宏说，这次陈水扁总统跟马英久主席之间的会面是一次很重要的会面，大致上把他们两人在重大问题上的边缘(BORDER)都划分出来，把台湾基本的两种蓝绿族群中间在政治上的光谱、见解都做出非常清楚的说明。
杨宪宏说：“我觉得这是一个很重要的会面，最重要的是他们能坐下来，最重要是他们也很愿意倾听，即使是南辕北辙的看法，这是一个民主国家本来就应该有的。我也相信，这是第一、不是最后一次。”
*杨宪宏：会谈能理清未来问题*
杨宪宏说，陈水扁和马英久两人坐下来谈，才有办法接触真正的核心，反之，误解对方的可能性就会很大。他说，双方通过会谈能真正、有效地理清楚未来台湾的问题应该往那里去解决。
杨宪宏希望，这种形式的扁马会将来能再举行一两次，并在此基础上扩大会谈的规模，陈水扁总统这边邀请李登辉前总统或是台联党主席，马英久主席那边邀请连战先生跟宋楚瑜主席或新党领导人。他说，如果蓝绿两大阵营不坐下来谈，那么他们对台湾人民给他们的授权(MANDATE)就永远没有办法达成他们的理想。
东吴大学政治系教授盛治仁博士说，这次扁马会是各取所需，主要目的不是在于说明各自的立场。他说：“在马英久的部份是希望籍由这样的会面可以把过去民进党常常批评泛蓝的领导人愿意到大陆见大陆的领导人、愿意到美国见美国官员，可是不愿意见自己的总统。我想他主要的目的是把这个批评消除掉。对陈总统来讲，他的民意支持度是比较低的，他有个舞台，可以让他扮演总统的角色，我想他也会蛮乐意去参与的。”
*盛治仁：双方几乎完全没有交点*
不过，盛治仁教授也表示，在星期一的会谈中，双方在所有的问题上，包括军购、公投、终统、九二共识，几乎完全没有交点，双方也没有显示出吸纳对方意见作为自己未来的政策参考的意图。
盛治仁教授说，在这次扁马会举行之前，泛蓝阵营有些人极力反对，认为陈水扁靠不住，马英久可能会重蹈亲民党主席宋楚瑜的覆辙。2005年2月22号，亲民党主席宋楚瑜和陈水扁总统举行会谈。陈水扁跟宋楚瑜会谈前互赠礼物时，把写着“真诚”二字的墨宝送给了宋楚瑜。但是后来两人的关系非但没有因会谈得到什么改善，反而发展到翻脸的地步。 盛治仁教授说， 扁马会虽然不会重蹈扁宋会的覆辙，但也不会奠定双方未来继续会面的基础。
在星期一的扁马会之后，台湾联合报进行的民调显示，对台湾总统陈水扁的满意程度仍在两成的最低点徘徊，但不满意程度减少了六个百分点。国民党主席马英久的民众支持率从自美返台的六成七高峰下降到五成八，跌落了九个百分点。此外，泛蓝支持者中仅有三成八的人认同这次扁马会，认为没有必要的为四成四。
