台湾国防部星期四首度就两岸直航发表了四项原则，强调应以台湾安全为重，同时两岸航线必须定位为国际航线。
台湾国防部副部长康宁祥说，国防部经过10多次评估与调查，认为两岸航线必须比照国际航线，以国际公法加以规范来确保台湾的安全。他说：“避免直接穿越台湾海峡航行，以定点定线定时、 白天通航、先南后北的方式，夜间停航，包机直航，以不影响我军事安全为原则。”
康宁祥还强调，机场的规划必须与军用机场有所区隔，先由高雄小港机场担任直航机场，再考虑桃园中正国际机场，而台北的松山机场则不列入考虑。
* 打压马英九？ *
由于台北市长马英九日前才提出松山机场作为两岸直航机场的主张，康宁祥的说法引起了亲民党立委赵良燕质疑，是否有打压马英九的嫌疑。
赵良燕问：“是不是你在打马？”
康宁祥答：“我用不着打马，打马又不是国防部的任务。”
国防部副部长陈肇敏进一步解释，由于松山机场位于台北市内，周边都是台湾的政经中心，所以不能作为直航的试点。他说：“南边的话在小港(高雄)，是一个试验性质，因为北边的话，国家政经中心都在这个地方，别的地方做的好的话，这个地方再来做比较稳当。毕竟大陆和我们，两个太悬殊的条件，我们没有任何试验失败的机会。”
陆委会主委蔡英文星期四在立法院备询时也提出了两岸直航谈判的四项原则，一是政府主导，二是公权力不能被侵蚀，三是海基会优先，四是民间团体只是协助角色。蔡英文表示，两岸应先坐下来进行预备性磋商，商谈两岸直航的谈判模式。
* 学者认为直航不等于不安全 *
不少立委质询重点仍集中在两岸通航与春节包机直航。蔡英文对于包机直航的部份仅表示目前仍在评估当中，虽然已陆续收到各部会的技术评估，但是陆委会还没有召开跨部会的会议，因此目前不能表达任何固定的看法。
至于开放两岸直航会不会影响台湾的安全，陆委会委托学者研究的结论指出，国家安全不能与开放直航划上等号，所谓[木马屠城]更属无稽之谈。研究结论强调，两岸如果想进行通航，先必须面对的是航线定位，双方最好的表述应该是特殊航线。
淡江大学大陆研究所教授张五岳指出，两岸不通航并不能保障台湾的国防体系不受到威胁，同样，两岸直航也不是影响国防安全的主要因素，因为目前大陆对台湾国防安全的威胁根本不需要靠直航这个条件。
