美国总统布什要求伊拉克领导人限期出国流亡之后，台湾表示支持美国反恐，同时强调台湾爱好和平，避免恐怖主义威胁台湾。
一些台湾政府官员支持美国解除伊拉克武装的言论受到质疑之后，台湾政府表示支持美国反恐和攻打伊拉克的立场。台湾外交部长简又新在立法院答询时说：“中华民国第一不会介入任何战争，第二会提供人道援助，第三，中华民国基于长期跟美国的友谊，我们支持美国的立场。”有立委质询简又新说，是支持美国攻打伊拉克的立场吗？简又新回答说：“是。”
不过外交部长简又新否定了一天前外交部发言人呼吁伊拉克总统萨达姆在48小时之内下台流亡的说法。简又新称，外交部发言人先前的言论不代表官方立场。台湾媒体报导，多次独家播出本拉登谈话而声名大噪的卡塔尔半岛电视台反复播放台湾支持美国攻打伊拉克的消息，引起了台湾安全是否会受到威胁的忧虑。
前台湾国安会研究员翁明贤说：“阿拉伯国家，从给他们的整个观感来讲，会说台湾在美国打伊拉克的过程中为什么这样挺美，立场这样跟美国接近，所为何来，一般人不太了解，可能会把台湾看成是跟美国站在一起的，未来会可能因为仇视美国而对台湾的印象不好。”
台湾外交部长简又新表示，他在了解这些情况以后立刻展开了一些外交活动，努力化解相关报导在阿拉伯世界可能引起的不满情绪。他说：“外交部亚西司长也先告知驻台湾的各阿拉伯国家的代表，重新陈述我们的立场，已经做了这个工作。我们也会跟半岛电视台取得联系，我们中华民国不介入任何战争。”
台湾国际关系研究中心研究员何其忠认为，台湾应该尽量保持低调，避免麻烦。但是，目前在淡江大学国际事务与战略研究所任职的翁明贤教授指出，反恐是世界普遍接受的原则。他说：“今天我们强调支持美国反恐是因为反恐是全球社会的一个主流价值。反恐应该作为台湾的一个既定政策，这是不变的。”与此同时，台湾行政院发言人林佳龙星期三重申了支持美国反恐和台湾不介入战争的立场。
台湾民间团体[促进和平基金会]的领导人表示，台湾有55%的民众表示反对美国出兵攻打伊拉克。
