在2005 年困扰香港特区政府的有食物卫生安全和传染病的问题。先有中国大陆输港的鳗鱼验出对人体有害；7月，四川爆发猪链球菌疫症，特区当局对进口猪肉的检疫措施随即受到质疑；到了8月，中国大陆的输港淡水鱼发现含有致癌物质「孔雀石绿」，令香港人闻淡水鱼色变。
一名李女士说她很担心，现在没有胆子吃淡水鱼；另外一名的尹先生亦说：淡水鱼有孔雀石绿，对人的心理有所影响，他又不是天天要吃鱼，所以会暂时会选择吃咸水鱼。
而过去一年，香港一直被禽流感阴影笼罩，特区政府减少输港活鸡的数量，又计划立法规管进口鸡蛋，以减低禽流感传入香港的风险。
而综观2005年，最令香港人难忘的就是世贸组织第六次部长级会议期间，来自世界各地的反世贸示威者的抗争行动。世贸会议在12月13日揭幕，由12月11日开始到12月18日会议闭幕这一个多星期入内，每日都有抗议世贸的大型示威游行和集会。
12月17日，即是会议闭幕的前一日，反世贸示威在游行期间和香港警方爆发激烈冲突，双方对峙接近8小时，最后，警方采取行动，拘捕了超过1000名示威人士。及后，香港警方正式落案起诉其中14人，而其余的被捕人士就全部获释。
