日本虽然不是宗教色彩鲜明的国家，不过日本官民星期天还是对罗马天主教教宗约翰·保罗二世的逝世表示哀悼，并对他为世界和平所作的贡献深表敬意。
日本首相小泉纯一郎星期天上午向梵蒂冈驻日本大使馆传达了对教宗约翰·保罗二世逝世的哀悼之意。小泉的唁文说，他代表日本国民和政府对教宗保罗二世为世界和平所作的功绩深表敬意。日本外相町村信孝也在星期天上午向梵蒂冈外交部表达了类似的哀悼意向。
*教宗1981年访广岛长崎*
教宗保罗二世1981年访问过日本，除了首都东京以外，他还访问了二战中受原子弹轰炸的广岛和长崎两个县，并发表了废除核武器的演讲。星期天，广岛市市长秋叶忠利对保罗二世的逝世发表的哀悼声明说，教宗逝世，令人对他提出思考广岛被害，对和平负责的呼吁再次铭刻于心；广岛有决心坚定地推动世界废除核武器。
星期天日本各大传媒显著报导教宗保罗二世生前积极以行动致力于世界和平。
*日各地天主教堂哀悼*
日本不是鲜明的宗教国家，1亿两千万人口中，天主教徒目前约有45万人。自从传出教宗保罗二世病危的消息后，日本各地天主教会连日举行了祈祷康复的弥撒，但规模都不大。周日各地天主教堂的哀悼弥撒，人数由数十人到近千人不等。一些参加弥撒的教徒说，深感悲哀，但会继续教宗为世界和平努力的遗愿。
