为了保障参加亚太经济合作组织会议的领导人和高级官员的安全，上海采取了高度严格的保安措施。与此同时，对美国发动的恐怖袭击也将使反恐怖主义成为亚太经合会的一个主要议题。
*首次高规格多边会议*
这次亚太经济合作组织领导人非正式会议是迄今为止中国承办的最大规模和最高规格的一次多边国际会议。为了保障前来上海参加会议的各国领导人和其它政要的安全，特别是美国总统布什的人身安全，中国当局采取了高度严密的安全措施。上海市市长徐匡迪在新闻发布会上被问及中国所采取的安全措施的时候说，他不能够透露任何细节，否则就没有安全可言。但是他表示，在9月11号美国遭受恐怖袭击之后，中国采取了进一步的措施来保障与会者的安全。
*战斗机申城上空巡逻*
据《纽约时报》报导，在会议召开之前，中国的航空公司就停止向来自中东地区十九个国家出售机票。中国大使馆和领事馆也停止向这些国家的人发放签证。据【美联社】报导，警察每天都对上海主要来自新疆的回民进行严密的监视，包括要求回民餐馆的工作人员和顾客出示证件。
尽管如此，中国政府还是担心恐怖分子从中国与阿富汗和巴基斯坦接壤的西部边界进入中国，混入中国的穆斯林人口而来到上海。为了保证APEC会议期间不发生意外，中国当局将动用八架SU-27战斗机在上海的上空巡逻。这些战斗机还将为进入中国领空的与会外国领导人的专机护航。海军战舰也将在黄浦江上巡逻。在地面上也部署了由十万人组成的保安力量，保障各国政要的安全。
*利兹-卡尔顿按上监测设施*
在会议举行之前，在通向上海的各主要通道的检查站，都驻有警察，对所有进城的人和运货车进行检查。坐火车来上海的人也受到严格的盘问。在会议期间，上海市里的很多地方都禁止公众通行，只允许持有特别通行证的人通过。通向会场的道路也被关闭。参加会议的贵宾所下榻的五星级饭店将不向与会议无关的人开放。美国总统布什下榻的利兹-卡尔顿宾馆还耗费了二十万美元来购买监测和安全设施。
*谴责恐怖扭转世界经济*
尽管APEC会议历来的主题是自由贸易，由于美国遭到的空前的恐怖袭击，与会官员正在讨论是否将美国提出的反恐怖主义宣言纳入这次会议的最后宣言中。根据【法新社】得到的一份宣言草案，亚太地区的领导人将在这个周末的高峰会上，谴责对美国发动的恐怖主义袭击，并且承诺要加强对恐怖分子资金的控制，他们还同意在危机的情况下采取行动，保障石油的供给。
尽管会议的东道主中国强烈支持美国草拟的反恐怖主义声明，但是【路透社】报道，中国还是试图使大家把注意力放在全球正在衰退的经济以及贸易自由化在恢复全球经济方面所起的作用这个议题上，而不是被反恐怖主义这个问题所笼罩。中国同时还希望藉主办这次国际会议来显示中国所取得的经济成就。
