中国大陆和台湾是否达成过九二共识，也就是“一个中国，各自表述”，成为这次台湾选举中执政的民进党和在野的国民党就未来两岸关系发展争论不休的一个议题。有学者认为，为台湾本身的切身利益着想以及在各方的压力之下，陈水扁在大选之后迟早会接受九二共识的。
十一月二十七号上午在雄伟的国民党总部，台湾的国民党主席连战在行政院新闻局安排的记者会上，对来自外国和台湾的记者们阐述了国民党两岸政策的基调。他说两岸关系一定要基于一种良性的互动：“良性的互动应该是在所谓的九二共识，一个中国各自表述的基础上来，进行双方面的对话和协商来解决双方的问题。”
*连战批陈水扁讨好台独倾向选民*
连战指出，这个看法已经被陈水扁在这次的选举过程中完全否决了。他说陈水扁为了巩固他在总统大选期间的百分之三十九的票源，讨好有台独倾向的原教义派选民，维护他的政权而出此下策，置台湾整体安定利益而不顾。他希望陈水扁所提出的国家安定联盟，不是一个进一步分裂族群的步骤，把所有他认为可以拉拢的势力都拉拢在一起搞对抗。这样发展并不好：“短期来说，这也许可以维护他的政权安定。但是对国家来说绝对是不安定的。”
*林中斌指陈水扁已善意改善两岸关系*
然而行政院大陆委员会的副主任委员林中斌随后在陆委会举行的记者会中，却对目前陈水扁所实施的大陆政策加以维护和说明。尽管他以不在自己的权限之内拒绝对陈水扁否定九二共识加以评论，可是他却强调陈水扁已经尽了最大的善意来推动两岸关系的发展。他指出陈水扁在处理两岸关系上，基本上有很强的延续性：“我本人就是一个延续性的象征。”
林中斌指出，现在的陈水扁政府在两岸关系上有更明显的强调。他说第一个就是陆委会主委蔡英文讲的扁政府所追求的就是一个有来有往的有构架的两岸关系。第二个就是扁政府采取的是一个非常积极的促进两岸关系，经济和社会交流的政策：“包括去年十一月准许大陆记者来台湾驻点访问，今年一月一号开始小三通。还有最近宣布的允许大陆人士来台观光以及以前戒急用忍的政策将来要变成积极开放，有效管理，已经有很多社会和经济交流的政策。”
林中斌说陈水扁希望两岸人民从经济文化的统合恢复走向政治的统合。另外就是陈水扁对两岸恢复协商并没有预设前提条件。同时在言行上尽量的保持节制。不要让别人解释有意向北京挑衅。
民进党中国政策顾问、台湾文化大学美国研究所所长陈毓钧在接受美国之音记者访问的时候，表示陈水扁所以否定九二共识，是因为这是国民党执政时的政策，在没有确定之前他不愿意接受。另外一个原因就是这次选举压力很大。因为这一年半以来他的政绩并不理想。所以 他必须巩固去年百分之三十九的选票：“而且那些票源倾向于台湾独立的看法。所以他必须巩固他的票源等选完了再说。”陈毓钧说陈水扁和北京之间很难建立互信的关系，而且和北京对话沟通管道也不好。再就是陈水扁把九二共识也当作一种处理两岸关系的策略。
然而陈毓钧对陈水扁未来接受九二共识采取审慎乐观的态度。他指出美国政府最近表示，确实有九二共识的存在而且那是两岸和解、和平的最必要的东西。加上台湾经济不能忽视两岸加入WTO后经济全球化的影响：“如果九二共识僵局无法打开，就不能对台湾这样一个全球化的经济布局，还有就是经发会的很多政策无法落实。从国家利益考量他必须重新思考。”
