在台湾以针砭时政著称的学者团体澄社星期一和陈水扁总统进行了座谈，除了批评政府倾向财团之外，也认为政府的决策能力出现了问题。
澄社和陈水扁总统座谈的时候，向陈总统提出了国是诤言。澄社批评，一般观感认为新政府过度讨好资本家，加上以政治权位酬庸特定人物的传言不断，令人质疑执政者向财团倾斜，形成新的政商利益集团，陈总统应注意新政府是否有向财团倾斜的现象，适时加以澄清，以维持新政府公正与阶级中立的立场。
对此，陈水扁表示，他会注意这方面问题，不过他是以肯定取代指责，希望从比较正面的角度来看社会多元不同的力量。长期观察台湾政治发展的前瞻政策基金会负责人魏庸也对此也发表了看法：“过去民进党是一个中间偏左的政党，它是以社会福利、同情弱势团体作为号召，可是当政之后，一些措施看的很清楚，一些财团在选举时支持陈水扁总统，这些财团领袖之后就被选为国政团的成员，以后的政策看来是有跟财团接近的迹象。”
*忠诚考核是敏感问题*
澄社还批评，新政府执政以来最大问题是决策和组织效能、决策评估和形成机制都有问题，执政当局改革企图心不够强，格局不大，脚步凌乱、政策矛盾。澄社并且质疑，政府政策当中的忠诚调查、指纹建档、搜索媒体等过程大多是粗糙不堪，而庞大文官体系似乎还没有找到领导与尊重的平衡点。
前瞻政策基金会负责人魏庸也对政府有意针对公务人员进行忠诚查核提出质疑：“忠诚考核的内容目前还不清楚，在台湾是一个敏感的问题，因为台湾现在没有别的敌人，就是中国大陆，所以忠诚考核的问题是否会导致不同的党派，甚至不同的族群因素的渗入，忠诚考核就和一般民主先进国家的情形和标准不一样，而成为国内政争的来源，也成为不同族群之间的不信任，透过这个程序来操作是大家关心的问题。”
另外，澄社还指出，近来一些国营事业主管遭到撤换，引发争议，而不论是重要人事决策或政务性决策有时仍不免黑箱作业，权责也不够明确。陈水扁则表示，目前施政计划他完全授权内阁来执行，虽然包括忠诚调查、指纹建档、搜索媒体等他并没有主导，但做为总统他都要概括承受。澄社成员却表示，虽然陈水扁总统否认曾经主导这些人事案，但他们认为外界仍有很多疑问，他们希望陈总统可以提出更多的说明和证据。
