台湾台北和平医院因为萨斯疫情遭到封锁之后，29号继续传出有两名疑似死亡病例，院内还有一些医护人员出现了感染症状，显示疫情仍然处于严峻的态势，尽管台湾民众现在谈萨斯色变，不过，还是有200多位志工不顾生命危险，表示愿意进入医院提供协助。
但是，另一方面，地方上也出现了和萨斯有关的抗议场面，和平医院3名疑似萨斯病患28号下午送到新竹医院进行隔离，却引发新竹市长林政则带领里长堵路抗争，怒指中央政策错误，要求原车遗返。林市长说：行政官员是否可以宪法多读一点，因为中央和地方是分权的，我在民选的县市长里面，对我的市民选区有责任，今天中央突然送来了3个生病的人到新竹市来，而且这种病现在世界还束手无策，我当市长能不关心吗？
不过，对此，新竹地检署已经正式就妨害公务罪嫌及违反集会游行法进行了侦办。 面对地方县市的反弹声浪，行政院长游锡坤(方方土)则要求各县市应该运用公权力，确保贯彻防疫措施，游锡坤(方方土)认为台湾一定可以度过这个难关，他不希望在事件落幕后，回过头来检视整个过程，才发现人性的丑陋，他说，萨斯不但考验医护人员的专业能力，也考验台湾人的人性。
此外，台北和平医院的医疗废弃物由于送到南部云林县元长乡的一家环保公司焚化，也引起了当地乡民的恐慌，乡长率领了几百位乡民前往围场抗议，并且与警员发生激烈冲突，县长张荣味则前往疏通，希望乡民能将心比心。张荣味说：我们必需在全国这种状况之下，今天云林县也可能有萨斯的病患送到台北啊，也可能有这种现象，大家要将心比心。
*何大一指称反应过敏*
日前到香港参加萨斯国际研讨会的知名爱滋病专家何大一指出，全球对萨斯反应过敏，他呼吁公众不必太恐惧。 何大一表示，由于萨斯是一种新病症，大众对它所知不多，加上新闻报导的推波助澜，使得公众产生了过份的恐惧。
不过，台湾现在正处于萨斯蔓延时期，除了要求从疫区回台的旅客居家隔离10天外，许多机关医院大楼也都实施了进出量体温的措施，让一般民众心理不害怕也难，行政院长游锡坤(方方土)就强调，未来10天将是萨斯疫情的高峰期，只有大家合作，才能打赢这场战争，如果不合作，就会失败。
*停飞停业形同断航*
由于台湾政府采取最严格的隔离措施，目前陆续出现了后续效应，中正国际机场估计，不只交通部宣布的香港，加拿大，新加坡，越南隔离航线，其他航线都不敢来台湾了，光是在29号，就有一百个航班取消入出境。航空业者不满政策太突然、变化太大、反应不及，业者预期会先有一段净空期，最后终将出现形同断航的景况。
