专家以及多国政府表示，东南亚地区的反恐还尚没有告一段落，恐怖主义仍然是这个地区安全与稳定的头号敌人。
*反恐初见成效 战斗远没结束*
近来，美国、澳大利亚和印尼政府高级官员和亚太地区反恐专家都警告说，这个地区的反恐努力虽然见到了一些成效，但是这场与恐怖主义分子进行的战斗还远远没有结束。
据美国一位不愿意透露姓名的高级官员透露，8月间在泰国被捕的东南亚地区恐怖组织“伊斯兰祈祷团”重要成员汉巴里表示，他和另一名恐怖组织成员亚兹苏发特曾经共同进行炭疽菌计划。情报组织说，这个炭疽菌计划已被搁置，因为恐怖组织无法找到能轻易被散布的炭疽菌成份。不过，美国有关官员仍很担忧，因为在这个地区，依旧有恐怖要员在尝试找到这种成份。
另外，印尼政府再度向华盛顿提出呼吁，希望审讯汉巴里，因为雅加达担心属于这个组织的成员正在策划另一个恐怖攻击事件。印尼警方认为目前有两个与制造去年10月12日巴厘岛爆炸案类似的炸弹仍在恐怖主义者的手中。据印尼情报机构说可疑的恐怖分子目前已经放弃使用任何电子通讯设施，以防被跟踪。警方表示恐怖分子和其同情者使用手写字条，或是面对面交谈的方式传递信息。
*恐怖网络仍在运作*
不久前，印尼政治安全统筹部长尤多约诺表示到目前为止，印尼当局还没有完全了解该国恐怖网络的具体情报。他说：“让我们感到担心的是我们不清楚到底印尼国内有多少恐怖主义小组，他们又有怎样的攻击能力。我们到现在为止还在追捕受通缉的两名极端危险的地区恐怖主义分子。”
就在几天前，于澳大利亚首都堪培拉举行的印尼-澳大利亚安全会议上，澳大利亚国防部长希尔也曾经指出，恐怖组织“伊斯兰祈祷团”领袖汉巴里在泰国被捕事关重大，但并未对该组织造成致命一击，这个恐怖网络仍然存在。
他说：“没有迹象显示本地区内，伊斯兰祈祷团成员的被捕严重影响到这个组织的指挥与控制。尽管在这个地区，该组织已经有200多名成员，其中不少是高级成员被捕，可是他们仍在策划和执行着攻击行动。”
他说，根据有关资料显示“伊斯兰祈祷团”有可能集中火力要对菲律宾发动更为猛烈攻击。 而首都马尼拉则是伊斯兰祈祷团在东南亚最大的目标。他说：“伊斯兰祈祷团将主要的注意力集中到了菲律宾。因为那里充斥太多西方俱乐部、迪斯科舞厅、旅馆与跨国企业及快餐店等西方文化象征，这可能是东南亚最显著攻击目标。以主要基督徒区的西式休闲设施作为攻击目标，正符合“伊斯兰祈祷团”的操控手法。”
希尔国防部长还表示目前，有证据显示“伊斯兰祈祷团”正在与菲律宾国内的恐怖组织，例如“圣剑”和“摩洛伊斯兰解放阵线”加强合作，旨在这个地区扩大恐怖主义的影响力。
*东南亚成为恐怖活动中心地带*
世界著名的反恐专家、新加坡战略研究所的客座研究员古纳拉特纳博士近来也指出，东南亚地区已经成为了世界恐怖主义的中心地带。因为这里有很多同情、支持基地这样的恐怖主义组织的穆斯林。他呼吁澳大利亚加强与东南亚地区国家的反恐合作，进一步打击地区恐怖分子。
就在泰国首都曼谷即将于一个星期之后主办一年一度的由21国领袖参加的亚太经合组织APEC领袖峰会之际，泰国警方也加紧了反恐搜查行动。稍早有报导说恐怖分子曾经从邻国柬普寨偷运肩扛式火箭炮进入泰国。
