在美国遭遇了恐怖组织袭击后，日本也像大部份国家一样，经历了震惊与愤慨的情绪。虽然日本始终保持坚决支持美国的立场，但是在美国准备报复恐怖组织的过程中和北大西洋组织决定同步行动后，日本作为美国的同盟国，能做什么，成为这个周末日本国内纷纷议论的话题。
11号深夜，日本的观众从电视机里看到了美国遭遇的袭击。一个多小时后，观众看到了朝日电视台记者和其他几家电视台驻纽约记者一边从倒塌的世界贸易中心现场逃命，一边仓惶地报导现场所见的状况和他们的声色里传递的恐惧讯息。
日本首相官邸这晚也通宵作业，首相小泉纯一郎在官邸设立了安全保障对策本部，次日一早小泉主持了第一次会议后，宣布了日本政府的决定。 他说：恐怖组织不仅针对美国，而是对整个民主社会的重大挑战，日本不惜代价地支持美国政府和人民。他宣布了6条具体措施，包括准备派遣国际援助队等，只等美国表示需要。在小泉开记者会时，两架政府专机从北海道自卫队千岁基地调到东京羽田机场待命，准备随时输送自卫队组成的国际援助队。同时，由于美国通知日本，恐怖组织也打算袭击日本和韩国的美军基地，日本所有美军基地星期三都进入了一级戒备状态，日本警察和自卫队也抵达各基地执行保安。
此外，民间还关注31家设在纽约世贸中心的日本银行和公司职员的安危。随着几天来日本没发生恐怖活动，美国也没有要求，国际援助队星期四解散，民间的关心除了在纽约仍失踪的24人外，回到与美国有关的本身问题上来。这些问题包括：日本经济是否因为战争更恶化？日本究竟能援助美国些什么？
前防卫厅副官石破茂认为，日本应该修改宪法。 他说：过去都是美国要什么，日本给什么，要不然就是出钱，此外好像就没什么可做。他还认为：日本应该修改自卫队法，使日本不要限于周边有事，而是更直接、更广泛地参与国际军事活动。他这种意见，目前在日本政界正在快速地占上风。执政三党干事长星期四晚上达成共识，准备这个月27号国会开会时，提议修改宪法以及自卫队法，目标是明年1月通过。但是，因为美国总统布什与中国国家主席江泽民先通电话，小泉纯一郎星期四晚上才接通与布什的电话，使日美关系成为关注焦点。小泉星期五晚上在东京外国记者会被追问时，与前几天的态度也有不同。 他说：美国的报复行动具体是什么，现在还不清楚，但是无论如何日本愿意在可能的范围内坚决支持美国。小泉这次没说具体的支持项目，正像当天早上他的内阁会议后，包括防卫厅长官在内的大臣纷纷表示应慎重考虑修改宪法的态度一样，令人显得异常。
日本拓殖大学国际关系教授森本敏认为：这可能与美国的战略思想有关。森本敏说：美国这次是一个全球性打击恐怖组织的战略部署，包括中国、俄罗斯等在其它一些问题上有歧见的国家，美国也许不希望这个时期，因为日本出兵或者修宪使亚洲节外生枝。他还认为：至少在美国这次行动开始前，日本来不及修宪，因此只有资金支援。91年美国出兵波斯湾时，日本援助了130亿美元，这一次日本正处严重经济萧条期，也许日本不但宁愿派遣援助队，减轻援助资金，而且更希望借机，修订早已想改的宪法。
