加拿大的穆斯林团体认为，自9/11事件之后，加拿大穆斯林社区受到了不公正的对待。警方和情报机构往往把穆斯林人士和恐怖分子相联系。
在独立调查委员会就一名加拿大籍穆斯林人士被错误遣返到叙利亚一事进行的公开调查中，几位专家都证实，加拿大皇家骑警和情报局在打击恐怖主义的行动中越来越多地把注意力集中在穆斯林社区。
同时，一个代表加拿大穆斯林人士的团体公布了对4千多位加拿大穆斯林人士的问卷调查结果。调查显示，有8%的受访者表示，9/11事件之后他们曾受到警方和情报机构不同形式的调查，调查的内容都涉及到他们被怀疑同恐怖组织有关。半数以上的受访者认为，加拿大穆斯林社区在打击恐怖主义的行动中成为无辜的受害者。
*穆斯林团体发言人呼吁政府调查*
进行问卷调查的穆斯林团体发言人萨洛基呼吁加拿大政府对穆斯林社区受歧视的情况展开调查。萨洛基说：“加拿大的穆斯林同其他人一样每次受到这种不公正的对待都会使我们这个国家的法制受到削弱。”
萨洛基表示，许多和平的穆斯林人士对警方和情报机构的作法表示不满，对他们的调查也往往采取不合作的态度。萨洛基说：“每当一个社区不公正地成为警方的关注目标，这个社区的人感到自己受到二等公民的待遇，这就会使维护国家安全的工作更难以开展。”
*副总理否认警方歧视穆斯林*
但加拿大主管国家安全的副总理麦克莱伦否认警方和情报机构存在种族及宗教歧视。她表示，警方和情报机构所有针对恐怖主义的调查都不是根据种族或宗教信仰展开的。
