美国星期四重新开放领空之后，美国机场的运作远远没有恢复正常。在华盛顿，里根机场由于距离白宫和国会大厦太近而仍然被无限期关闭。与此同时，已经开放的机场也在不断更改航班的起落时间。这种情况给世界各地的机场运作带来困难。
亚洲许多航空公司星期五继续取消飞往美国的航班，成千上万的旅客仍被迫滞留在原地。香港最大的航空公司国泰航空公司表示，美国当局要求外国飞往美国的航班实行更严格的安全措施，这些航班现在必须一个一个地得到批准。国泰表示，香港飞往加拿大温哥华的航班将会起飞，但是飞往纽约和洛杉矶的航班已被取消。同时，飞往多伦多，旧金山以及另一个飞往洛杉矶的班机是否能起飞现在还不清楚。
星期五，有数百位旅客在香港机场询问他们的航班情况，其中有不少是美国人。据报导，香港机场已经大大加强了安全措施，警察牵着警犬在机场内和附近地区巡逻。香港机场当局在一份声明中表示，从北美洲起飞的15个客机航班中，只有一架按时抵达，另外12个航班被取消，还有两个航班抵达的时间被延后。而在15个飞往北美洲的客机航班中，只有一架班机按时起飞，6个航班被取消，另外7架班机是否起飞还没有决定。
*上海机场美国班机受到24小时守护*
在空中运输方面，星期五，有四架货运航班从香港起飞，前往美国，其中有两架属于联邦快递公司。在日本，日本航空公司取消了7架航班，其中有一架班机是飞往芝加哥的，另一架前往温哥华。全日空公司则表示，星期五该公司飞往美国的8个航班都没有被取消，但是到上午11点它们的起飞时间还没有确定。
在韩国，两家主要的航空公司表示，取消飞往美国的航班使它们蒙受1千5百万美元的损失。两家公司星期五总共取消了12个飞往美国的航班。台湾的中华航空公司本来说，它星期五将恢复所有的航空服务。但是它后来表示，飞往美国的航班仍然不能恢复。两个被迫滞留在阿拉斯加和夏威夷的航班将在星期五晚些时候抵达台湾。
在上海，停留在那里的美国班机受到武装警察24小时的守护。机场当局表示，星期五所有飞往美国的航班都被取消了。北京机场的官员说，星期六飞往美国的航班也已经取消。
在新西兰，航空公司表示取消了14个航班，其中一些是飞往美国或是飞越美国领空的班机。在欧洲，飞往美国的班机星期五也无法起飞。德国的汉莎航空公司星期五取消了27个航班，法国和瑞士航空公司也在这样做。英国航空公司表示，将恢复部份从英国飞往加拿大的航班，但是飞往巴基斯坦伊斯兰堡的班机仍然停飞，因为巴基斯坦与阿富汗交界，而阿富汗窝藏着恐怖袭击事件的主要嫌疑人本拉登。