日本首相小泉纯一郎凌晨在临时召开的记者会上说，坚决支持美英开始对阿富汗采取的军事行动，日本政府也在星期一布置了相应的措施。不过过去几个星期日本的多项民意测验显示， 大部份的日本国民不支持美国对恐怖组织采取军事行动。
小泉纯一郎说，美国总统布什和国务卿鲍威尔在轰炸开始前都电话通知了他，布什还提醒日本充份认识这场军事行动的长期性。有记者提出，日本积极支持美国，是否会成为恐怖分子攻击的对象，小泉批驳这种想法，他说：担心参预反恐斗争会遭报复，这是向恐怖主义屈服，这正好中了恐怖分子的圈套。小泉指出：日本政府不能逃避，要同美国和国际社会联合起来，打击恐怖主义。
数小时后，小泉按照预定计划出发访问北京，而留在国内的内阁大臣们星期一纷纷指示各部采取相应措施。防卫厅长官中谷元星期一说，防卫厅的措施是三加强，他说：已经指示加强自卫队中央指挥所的体制，加强美军基地和美国设施、以及都市安全的警备体制和加强收集情报的体制。
*加强戒备防止恐怖破坏*
除了自卫队以外，星期一警察厅也全面出动。随着日本各地美军出动，警察厅向全国美军基地和美国的设施派遣戒严警察，在东京各繁忙商业地区的车站，星期一也出现了警察特种部队戒备。此外，主管出入境的法务省指示加强出入境证件检查，主管机场、港口的国土建设省指示加强安全检查，而外务省则表示，不排除派遣自卫队飞机迎接战区日本人回国避难等等。
日本联合执政三党8号决定，鉴于美国开始军事行动，有必要尽快通过日本政府5号提交国会的反恐法案，以便派遣自卫队为美国提供后方援助，为此打算敦促反对党合作，加快审议日程。力争20号在上海召开亚太经合会议前在众议院通过，本月内使法案成立。
*向阿富汗邻国提供紧急援助*
日本外相田中真纪子8号在记者招待会上公布：为援救美国军事行动中出现的难民，日本政府决定，除了前不久已经决定为巴基斯坦和联合国紧急无偿援助以外，今后还打算对巴基斯坦提供追加援助，以及为阿富汗邻国提供援助。
由于星期一是日本假期，东京股市没有开市，大部份日本国民只是不断从传媒滚动报导美英军事行动的相关新闻里，获悉最新的消息和亚洲各地的经济行情，猜测星期二开盘的东京股市下跌的幅度有多大。
在过去几个星期，日本各传媒所做的民意测验显示，超过半数的国民不赞成美国对阿富汗采取军事行动，认为战争不能遏止恐怖活动，只会有更多无辜百姓丧生。同时日本国民担忧的是，长期的战争会给全球经济带来坏影响，令本来就陷入困境的日本经济雪上加霜。一些在中东投资的日本企业，例如本田汽车、丰田汽车等表示对前途非常忧虑，而日本政府经济产业省属下的日本贸易振兴会最近也警告说，中东的战争势必打击日本的出口业。
